愛德與阿爾在北方失散之後便分開行動。阿爾在馬可醫生、斯卡的協助之下，成功的打倒人造人之一的恩維，並且與自己的爸爸─霍恩海姆重逢。另一方面，愛德也遇到因故奪回身體控制權的麟。就在這時候，阿爾從霍恩海姆口中，愛德則是從麟口中得知一個關鍵字，這個字就是「約定的日子」…