灰太狼發明了控制器，想要任意操控天氣，但卻激怒眾天氣，引來反擊！青青草原遭到狂風、暴雨、雷電等的強烈破壞，動物們只好準備逃離家園，紛紛登上方舟飛船，但是，少了「蛇族」，方舟便無法啟動……原來，在遙遠的以前，動物們都認為蛇會帶來詛咒，於是聯合驅趕蛇族，蛇族只好從此隱居，不再出現在大家面前。為了能啟動方舟，拯救大家，村長派出喜羊羊他們前往尋找蛇族的蹤跡……