在正邁向文明開化的明治時代，政府為推行西化而極力否定妖怪的存在，還實施了『違式怪異條例』，取締所有與妖怪相關的物品。此時，有一間神秘的租書店「向兔堂」卻反其道而行，專門偷偷收集與妖怪有關的書籍。店主兔崎伊織在幼時被某種妖怪附身，因此能看到、並與妖怪溝通。為了查清附身妖怪之身份，伊織收集各種妖怪書藉，並與貓妖阿銀、化貍千代一起幫妖怪解決煩惱。