當代新儒學宗師牟宗三先生雖然認為佛教思想與中國固有之文化生命有所違離，但卻從沒有否定佛教之價值。他以「般若」與「佛性」為佛教教學的兩大綱領，前者為一切佛教教學系統都不能違背的「共法」；後者因涉及對一切法之說明，所以是決定佛教各系統是否圓滿的關鍵。

　　根據牟先生對佛教各系統的判別，中觀教學所發揚之「體法空」精神乃一「共法」，並不能決定教乘之或大或小。瑜伽行教學因只對染法的生起有較圓滿的交待，故是「始別教」；如來藏真心教學雖對染法和淨法之生起有所交待，但以解脫須斷除染法而得，故為「終別教」。

　　至於由真心思想發展而來的華嚴宗教學，亦因「緣理斷九」才可使真心朗現故，所以只是「別教一乘圓別」。牟先生繼而指出，天台宗所闡揚的「不斷斷」、「一念三千」學說，不單能為一切法作出根源的說明，也是般若非分別說的進一步發展，所以能圓滿地體現佛性與般若這兩大主題，是最圓滿的佛教教學系統。