全身義體少女?七轉福音能夠操控《潘朵拉裝置》，這個裝置可以暫時將無數的技能安裝到義體裡面。庫拉莉翁是她的伙伴。多腳式巨大挖掘機《布耶爾》曾經給賽楠庫爾島帶來毀滅性的災害，目前則位於地下深處，已經停止了活動。亞美利堅帝國的克魯茲上校看上布耶爾的強大戰鬥力，想要暗中收回布耶爾，策動了「打撈沈船」計畫，連島軍也被捲入其中。但計畫受到布耶爾本身的防衛機能阻擋，最後以失敗告終。另一方面，福音與庫拉莉翁已經逐漸習慣了島上的生活，她們之間的關係卻開始產生了新的變化…？