原本應該是無比快樂的高中生生活在等待我去享受的。可是實際生活中卻是一個接著一個的血腥事件困擾著我！當然我也有甜蜜愛情的煩惱……咦！小蘭要上哪兒去？

　　棘手案件一椿接著一椿，我的身體已經快不聽使喚了！天啊！怎麼回事！？為什麼我渾身發熱，好像快熔化……大家期待已久的壓軸好戲正式開鑼囉！！

　　以高中生偵探馳名全國的我，卻無變回小孩子模樣……而在和一群小鬼玩遊戲時，竟有一名小女生下落不明！？想要悠哉悠哉地泡個溫泉，誰知又發生殺人事件！！我好想休息一下啊∼畢竟我現在只是個小學生呀……

　　在小蘭面前差點暴露身份的我，急中生智逃過一劫！！不過我還是希望能早點變回原來的工藤新一，好讓小蘭安心……但接二連三發生的事件，害我無暇追查黑衣男子的下落！！這次爸爸的著作「黑夜的怪男爵」竟然現身、從天而降。

　　接到謎樣的邀請函，我們一行人前往孤島解謎，卻捲入了多起離奇的奏鳴曲殺人案……終於案情明朗了，但我卻莫名其妙地多出個女朋友！？想我柯南破解疑案無數，啥也難不倒，但女人心、海底針……我真是迷糊了，請各位告訴我怎麼讓小蘭消氣吧！

　　身體雖然變小，但還是不輸給那些魁悟的大傢伙哦！這次我被一個囂張且戴面具的男子追尋走段無路，但我一定會用過人旳智慧逃脫，並拆穿那傢伙的真面目！我就是小小名偵探，江戶川柯南。

　　身體變小孩，許多危險就不斷跟著我，今人心驚膽跳的離奇案件也一一發生在我身邊！！連親愛的小蘭也遭襲擊！！不過……憑我機智的頭腦和身上的七大法寶，兇手可是無所遁形哦！我的名字就是名偵探，江戶川柯南。

　　身體矮小，頭腦卻聰明絕頂；憑著超人的推理能力，使一樁樁縣疑案件得以水落石出！希望能早日揭發神祕黑衣男子的陰謀，還我本來面貌！這也是為了我最親愛的小蘭，我，正是足智多謀的名偵探－江戶川柯南。

　　高中生的新一變成小學生柯南之後，還是不改偵探本性，屢次挑戰更棘手案件！不過……如果不小心點。露出馬腳，那可就慘囉！！

　　新一暫時寄住小蘭家，一面也積極想找出神秘組織的下落。為了隱藏身分，他化名”柯南”，並且還降級唸小學。跟在小五郎身邊辦案的柯南，以他冷靜的頭腦及清晰的推理，即使案子再棘手，也能一一破案。

　　以福爾摩斯的推理能力而聲名大噪的高中生名偵探，工藤新一，在一次追線索時，被歹徒強行灌下不知名的藥，一夜之間變成了一個小孩，化名為”江戶川柯南”。

四魂之玉散成了

碎片了－－

為了收集這些碎片

阿籬與犬夜叉

攜手合力奮戰！

邪惡的男子，奈落離開了......

而應該已歸西的桔梗竟還活著！？

究竟這位美麗的女子

她的目的又是什麼？