中華民國審計部獨立行使審計職權，監督政府及其所屬機關預算之執行，並就其運用資源之經濟性、效率性及效果性進行考核，本專案審計報告揭露臺北市立聯合醫院108至109年度採購及管理藥品情形，因現有機制無法發揮控管功能，屢有未待採購單核准即先行洽藥商供貨，致藥品契約金額用罄後仍持續進貨，並以緊急採購名義核銷後續貨款。另因內部控制欠佳，亦有付款單價與契約單價未符，及未驗收即先行付款或退還履約保證金之情事。此外，廠商未依約交貨致契約終止時，亦未經招標程序辦理替代藥品採購，且未扣留廠商貨款及進行求償等情，經臺北市審計處促請研謀改善，並揭露於109年度臺北市總決算暨附屬單位決算及綜計表審核報告，嗣經監察院立案調查並依法糾正，該院已檢討內部監督機制失靈原因，並擬具強化藥品管理、加速資訊系統整合及修訂採購標準作業流程等改善措施，以端正採購秩序。