很多菇菌類是藥膳兩用的真菌，由於其中含有B-葡聚糖、三?類化合物及一些特定的代謝物具有生理活性，如:抗氧化性、調節免疫、降血脂、抗腫瘤、降血糖等功能，故常作為保健食品的原料，被製成膠囊、錠粒、濃縮液、飲品、沖泡粉、營養添加物或化妝保養品等產品。最經典出名的保健用菇菌類是靈芝，因為早在「神農本草經」即視靈芝為神奇藥方，中研院研發團隊已發現靈芝多醣具有強化免疫、抗癌的效果，主要關鍵是一種叫「岩藻醣」靈芝多醣，它能夠誘導出抗體、進而消滅癌細胞。