本專案審計報告揭露新竹縣、市政府辦理河川水質汙染防治情形，未能有效抑減發生中度汙染等級以上河段、多重汙染源稽查制度及強度待提升、整體政策推動資源之評估未盡周延、汙水下水道用戶接管工程推動進度遲緩等情形，經審計機關促請研謀改善，已調整或新增河川水質監測點位、辦理聯合稽查強化多重汙染源管制、積極提撥預算經費辦理環境水質改善相關業務。