與其他醫學名家相比，朱丹溪的醫道帶有鮮明的「理學」特色。
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在他看來，宇宙萬物的「理」是相通的，某種程度上，治病跟「齊家、治國」一樣，正是這份通透和練達，讓他每每藥到病除。
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在深厚的傳統醫學內涵之上，朱丹溪與時俱進，大膽創新，將心理問題納入生理疾病的診治中，解決了許多疑難雜症。
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朱丹溪之所以被後世敬仰，除了高尚的醫德、高超的醫術外，還展現在他的「獨特」上：他不僅治病救人，還能給一個人「自我調養」的方法，正如他所說：「與其救療於有疾之後，不若攝養於無疾之先。」可見，自我調養在他心中的地位。
